В 1996 году Томас возвращается к работе в игровых шоу, появившись в эпизоде сериала «Сабрина — маленькая ведьма». Затем последовали появления в таких шоу, как «Лоис и Кларк: Новые приключения Супермена» (1996) и «Чудики и чокнутые» (1999) (сериал продержался в эфире всего один сезон) в роли школьного тренера Бена Фредрикса. Всё это время актёр работал над озвучением, также появившись в мультипликационной комедии «Пинки и Брейн».

2000-е

Новое тысячелетие ознаменовалось для актёра волонтёрской работой в качестве певца католической церкви Святого Тимоти в городе Меса, штат Аризона. А в 2003 году снялся в псевдо-документальной картине «Trial and Error: The Making of Sequestered».

В том же году Уилсон озвучил одного из персонажей телевизионного продолжения диснеевского мультфильма «Атлантида: Возвращене Майло». Интересной, что в первой части главного героя озвучил Майкл Джей Фокс. Наконец в 2004 году голосом Уилсона заговорил один из персонажей культового комедийного мультсериала «Губка Боб — квадратные штаны».

Уилсон продолжал озвучивать персонажей компьютерных игр. В 2004 году сыграл роль Ноа Кёрри в постановке мюзикла «110 In The Shade» Когда актёр снимался в сериале «Говорящая с призраками» (2005), Томас Уилсон попал в знакомую обстановку: большинство его сцен было снято в тех же декорациях, что и трилогия «Назад в будущее» — на площади Городской мэрии. В том же году, у Уилсона выходит первый комедийный альбом под названием «Tom Wilson Is Funny!». Уилсон исполнил песню «Sleigh Ride» с группой «Relient K» на «Вечернем шоу Джея Лено», сыграв на акустической гитаре. Группа, являясь большим поклонником Уилсона и трилогии, пригласила актёра выступить с ними на шоу.

Затем Томас записывает песню под названием «Biff’s Question Song», в которой он даёт понять поклонникам, что немного устал от их однообразных вопросов, ответы на которые уже от зубов отскакивают, о своём персонаже Биффе Таннене и коллеге по трилогии Майкле Джей Фоксе. К 2008 году у актёра за плечами были появления в таких шоу, как «Любой ценой», «Юристы Бостона», «Кости», «Эд», «Два с половиной человека» и «Доктор Хаус». А в марте 2009 актёр появился в пилотном выпуске комедийного британского шоу «Vidiotic».

Фильмография

Кино

• 2013: Копы в юбках / The Heat — Капитан Вудс
• 2011: Первокурсник-миллионер / Billion Dollar Freshmen — Директор Престон
• 2010: Дубль 22 / Tаke 22: Behind The Scenes Of Sequestered — Терри Питерсон
• 2010: Юхан-скиталец / Yohan — Barnevandrer — Кевин
• 2009: Информатор / The Informant! — Марк Чевирон
• 2008: Дом вдребезги / House Broken — Генри Декер
• 2006: Капитан Зум: Академия супергероев / Zoom — Учитель Дилана
• 2006: Санинспектор / Larry, The Cable Guy: Health Inspector — Барт Тэтлок
• 2003: Trial & Error: The Making of Sequestered — Терри Питерсон
• 2003: Life On Parole (ТВ)
• 2000: Team Boy — Том
• 1998: Gargoyles: Brothers Betrayed (видео) — Мэтт Блустоун
• 1998: Люди в белом / Men In White (ТВ) — Эд Клингботтом
• 1998: Фанатка / Girl — Продавец билетов
• 1997: steve.oedekerk.com (ТВ) — Покупатель / Ведущий ток-шоу
• 1997: Эта дикая кошка / That Darn Cat — Полицейский Мэлвин
• 1996: Андерсонвилль (ТВ) / Andersonville — Томас Свит
• 1995: Рождённая свободной / Born to Be Wild — Детектив Лу Гринберг
• 1994: Мистер писатель / Mr. Write — Билли
• 1994: Кэролайн, свидание в полночь / Caroline at Midnight — Офицер Китон
• 1994: Затерянный лагерь / Camp Nowhere — Лейтенант Эллиот Хендрикс
• 1993: Горное безумие / Mountain Madness (ТВ)
• 1993: Morning Man At 88.0 (ТВ)
• 1993: За кровь платят кровью / Bound by Honor — Ролли
• 1991: Нервы на пределе / High Strung — Эл Далби
• 1991: Назад в будущее: Путешествие (аттракцион) — Бифф Таннен
• 1990: Назад в будущее 3 — Бьюфорд «Бешеный Пёс» Таннен / Бифф Таннен
• 1989: Назад в будущее 2 — Бифф Таннен / Грифф Таннен
• 1989: Последняя поездка / The Last Ride — Бак Джонсон III
• 1988: Боевик Джексон / Action Jackson — Офицер Корнблау
• 1987: Умный Алекс / Smart Alex — Лейтенант Стивенсон
• 1986: Давай спасем Гарри / Let’s Get Harry — Боб Паховски
• 1986: День дурака / April Fool’s Day — Арч Каммингс
• 1985: Назад в будущее — Бифф Таннен
• 1985: Территория ниндзя / Los Angeles Streetfighter — Член банды Спайка