Покушение на Тревора организовал его брат Орен Гудчайлд, который связан с главой «мониканцев». Просмотрев видеозапись постельной сцены Тревора и Эон, совет Бренны решает сместить Тревора с поста председателя. Одновременно «мониканцам» приказано убить Эон за неисполнение задания. Тревор также приходит в реликл и узнает от Хранителя о приходе Эон. Он замечает, что все участники тест-групп были убиты полицейскими. Эон приходит по адресу Саши Трилоу и находит младенца вместе с напуганными родителями. Вслед за ней появляется Тревор, им приходится убегать от внезапного рейда полиции.

По словам Тревора, четыреста лет назад от вируса, поразившего население Земли, была найдена вакцина, побочным эффектом которой было бесплодие. Поэтому было решено тайно клонировать людей. ДНК умершего человека сохраняется, и затем на приёме у гинеколога женщине внедряется оплодотворённая яйцеклетка. Таким образом, умерший человек через 9 месяцев появляется заново. Гудчайлды на протяжении семи поколений клонируют себя, сохраняя власть и накапливая знания. В реликле над городом хранятся ДНК. Многолетнее клонирование также дало побочный эффект: людей преследуют странные сны и воспоминания. Клонирование задумывалось как временная мера. Однако после того, как женщины в одной тест-группе начали беременеть естественным образом, Орен приказал тайно уничтожать таких участниц. Он пришёл к выводу, что исцеление от бесплодия подорвёт власть Гудчайлдов.

Решив забрать результаты многолетней работы Тревора из лаборатории, Эон и Тревор вооружаются. По пути в лабораторию, Эон достает свою фотографию и Тревор говорит ей о том, что в прошлой жизни они были женаты (Эон тогда звали Кэтрин) и что он потерял её во время эпидемии и не смог вернуть её к жизни. С тех пор Тревор жил и умирал семь раз, храня образ Кэтрин в воспоминаниях. После этого разговора, Эон и Тревор понимают, что по прежнему любят друг друга и Эон вспоминает свое прошлое с Тревором.

Орен с большим отрядом вооружённых людей окружает Эон и Тревора. Он сообщил, что природа преодолела бесплодие и женщины уже способны рожать естественным путём. Однако Орен желает сохранить власть и решает продолжать клонировать людей. В перестрелке погибают все мониканцы, включая Ситандру, и Орен. Совет Брегны возвращает власть Тревору. Эон взрывает реликл с образцами ДНК, после чего разрушается купол и стена Брегны. Около разрушившейся стены, открывающую взор на девственно чистую природу, собираются люди, в числе которых держащиеся за руки, счастливые Эон и Тревор.

Они снова оказываются в 2011 году, Тревор спрашивает Эон: «Мы ещё увидимся?», Эон с улыбкой идёт в противоположную сторону дороги и последний раз они смотрят на друг друга издалека.

Интересные факты

Внутреннее помещение здания форума совпадает с внутренним помещением секретной базы ЦРУ из более позднего фильма режиссёра Джо Райта — Ханна. Совершенное оружие (2011 г.)

В ролях

• Шарлиз Терон — Эон Флакс
• Мартон Чокаш — Тревор Гудчайлд
• Джонни Ли Миллер — Орен Гудчайлд
• Софи Оконедо — Ситандра
• Фрэнсис Макдорманд — глава «мониканцев»
• Амелия Уорнер — Уна Флакс
• Николай Кински — Клавдий
• Пит Постлетуэйт — хранитель
• Кэролайн Чикези — Фрея

Производство и кассовые сборы

Съёмки проходили в Берлине и Потсдаме. На роль Эон Флакс приглашалась Мишель Родригес, которая играла в дебютном фильме Кэрин Кусамы «Женский бой» (2000).

Кассовые сборы по состоянию на февраль 2006 года составили $25,8 млн в американском прокате и $26,4 млн в мировом ($52,3 млн в итоге). Фильм вышел на DVD 25 апреля 2006 года. На 16 июля 2006 года объём продаж составил $31,8 млн.