Шеф полиции вызывает Осмозиса к себе, упрекая за самодеятельность и решает в целях исправления дать ему напарника, которого Осмозис едет встречать в аэропорт-желудок. Напарником оказывается противопростудная пилюля Дриксенол (или коротко — Дрикс) с сильным вишневым запахом.

Осмозиса и Дрикса посылают осмотреть воспаленное горло, где Дрикс на время снимает раздражение охлаждающей струей, а Осмозис тем временем осматривает сгоревший слюнный ботик, где находит маленького микроба — свидетеля первой атаки Трэкса. Тот называет вируса «La Muerto Rojo», но его случайно замораживает Дрикс, за что получает нагоняй от Осмозиса. Позднее Осмозис звонит в архив и расшифровывает имя незваного гостя -«Красная смерть».

Осмозис и Дрикс едут в носовую область, где, тем временем Трэкс с завербованными им микробами убивает охрану и вызывает прорыв шлюзов, чтобы вызвать симптом ложной простуды. Нескольких бандитов и самого главаря Осмозис замечает и кидается преследовать, но в этот момент «плотина» рушится, вызывая у Фрэнка обильные сопли, а Осмозиса с Дриксом утопив в соплях.

Мэр Флемминг толкает предвыборную речь, игнорируя советы своего заместителя, решив руководить городом-организмом Фрэнка по-прежнему, нимало не заботясь о здоровье и потакая слабостям своего хозяина. В это время заглядывают Оззи и Дрикс, мэр пиара ради жмет руку Дриксу, тогда как Осмозис безуспешно пытается втолковать главе города, что дело серьезнее, чем обычная простуда. Однако мэр советует ему «не мутить воду», после чего намекает на подмоченную репутацию. Осмозис и Дрикс ссорятся, однако на предложение мэра сменить напарника Дрикс отвечает отказом и позже говорит Оззи, что тоже хочет докопаться до правды. Осмозис рассказывает о случае на школьном фестивале, который стоил репутации ему и работы Фрэнку, Дрикс поддерживает его.

Дальше, они направляются в клуб который расположен в прыще на лбу Фрэнка. Оззи и Дрикс внедряются туда. И Оззи узнаёт план Трэкса: он хочет вызвать лихорадку в теле Фрэнка, тем самым убить его изнутри. Он хочет самым ужасным новым вирусом, который убивает каждую новую жертву быстрее чем кто-либо. Он планирует убить его за 48 часов, тем самым побив его предыдущие его рекорды. В клубе Оззи запускает гранату с лекарством в Трэкса и его дружков, вызывая кожный хлопок, и убив практически всех в клубе, и, судя по всему, их осада заканчивается. Тем временем, Фрэнк пытается убедить Мисс Бойд отменить запрет, который запрещает ему к ней подходить, чтобы он смог пойти в поход вместе со своей дочерью Шейн, но прыщ попадает на губы и она отказывает ему. Когда Оззи и Дрикс вернулись, мэр Флемминг ссорится с ними и увольняет их, заставляя их соответственно покинуть тело Фрэнка.

Трэкс переживает взрыв и, после убийства своих сторонников, решает атаковать в одиночку гипоталамус Фрэнка (часть мозга что контролирует температуру), отключив способность саморегулирования. По прибытию туда он испульзует свой заразный палец чтобы уничтожить протоплазменный барьер и вытащить молекулу ДНК. Вскоре поле этого Лея Эстроген, секретарь мэра и любимый объект Оззи, раскрывает его работу и вызывает охрану. Оззи, находясь в театре где показывают сны в мозгу, обнаруживает что Трэкс жив и экран в театре становится лихорадочно красным, а сон, который он смотрел, становится ночным кошмаром, где все смеются над Фрэнком. Он спешит остановить Дрикса от его ухода из тела и уговаривает его помочь остановить Трэкса.

Тем временем Лея во время поиска виновника натыкается на Трэкса. Тот берёт её в заложники и сбегает. Оззи и Дрикс едут из мочевого пузыря и замечают что температура растёт. Осмосис говорит Дриксу, если температура будет выше 40-ка градусов, Шейн осиротеет, то-есть Фрэнк умрёт.

Шейн в это время едет на автобусе в поход и подружка даёт ей искусственную ресницу. Тем временем Трэкс угоняет машину и его начинают преследовать. Фрэнк же в это время едет с братом Бобом в Буффало. Внутри него уже всё начинает краснеть из-за температуры. Оззи слышит что у Трэкса в заложниках Лия. Полицейские говорят что машина движется к язычку. Герои направляются туда.

Фрэнку становится совсем плохо и Боб отправляет его в больницу. Мэр Флемминг в отчаянии кричит. Мимо скорой проезжает а втобус и Шейн узнаёт своего папу. Она вместе с дядей Бобом едут за ними в больницу. Оззи и Дрикс настигают Трэкса в язычке. Оззи спасает Лею, а Дрикс во время выстрела промахивается и замораживает заразный палец Трэкса. Вирус разбивает перепонку окна и готовится сбежать но его окружает полиция. Тогда он вызывает у Фрэнка кашель с помощью пыльцы и сбегает из тела.

Оззи залазит в пушку Дрикса и тот стреляет в Трэкса. Он хватает его и они оба падают в глаз Шейн. Там между ними затевается драка, в которой Трэкс побеждает. Он готовится задушить Джонса, но внезапно Шейн моргает и их выбрасывает на искусственную ресницу. Трэкс протыкает Оззи пальцем, но лейкоцит перехитряет его, сделав дыру в теле, в результате чего рука Трэкса застряёт в реснице. Джонс хватается за ресницы и искусственная падает в спирт. Трэкс пытается всплыть но погибает.

Шэйн уводят и у Оззи не остаётся шансов вернутся назад. Тем временем температура разрушает город. Фрэнк умирает. Шейн вырывается из рук врачей, приходит к папе и извиняется перед ним за всё. Осмосис пользуется тем, что Шейн плачет, и со слезой падает в рот Фрэнка. Цепь Трэкса, в которой хранятся украденные хромосомы несут в гипоталамус. Фрэнк оживает.

Осмосису Джонсу возвращают работу и полномочия. Дрикс становится его напарником. Шейн и Фрэнк идут в поход, а Мэр Флемминг с пуком улетает из Фрэнка.

Интересные факты

• Фильм изобилует отсылками на советскую мультипликацию. Эпизоды с яйцом, прибытием Дрикса и госпитализацией того, кто съел яйцо — отсылки к похожим сценам из советского мультфильма 1973 года «Митя и микробус». Сцена гибели главного злодея — отсылка к советскому мультфильму 1986 года «Конец», где главный персонаж тонет в водке.

В ролях