К команде учёных присоединяются Боб Айверсон и Ребекка Чайлз. Теперь они официально называют себя «терранавтами».

В то же время ФБР задерживает хакера по кличке Крыс, но не для наказания, а чтобы тот помог военным контролировать Интернет и не допустить паники людей.

По всей планете начинаются масштабные катастрофы, вызванные сдвигом магнитного экрана планеты. В Риме происходят сильнейшие удары молний, убивающие людей и уничтожающие здания. Молнии бьют по Колизею, и амфитеатр превращается в груду камней.

Спустя 3 месяца строительство корабля завершено. Команда готова спуститься в земные глубины. Кораблю дают название «Вергилий», после чего он стартует в районе Марианской впадины. Пройдя через толщу воды под пение китов, команда активирует лазеры, и они проникают в земную кору. Спустя 15 минут «Вергилий» погружается в мантию.

На глубине в 700 миль корабль случайно попадает в гигантский полый «пузырь» внутри мантии — кобальтовый кокон. Лазеры оказываются зажатыми гигантским кристаллом, и команде приходится выйти наружу. Эдвард начинает резать кристалл. При проникновении в кокон, корабль повредил его оболочку, и поток лавы начинает заполнять его изнутри. С высоты сыпятся мелкие кристаллы, которые повреждают кислородный шланг резака. Джош подсоединяет к нему шланг из своего скафандра. Кристалл распиливают, а Джош теряет сознание от недостатка кислорода. При запуске лазеров голову Боба Айверсона пробивает осколок кристалла, после чего он падает в лаву и погибает. Место первого пилота занимает Ребекка и «Вергилий» покидает разрушающийся кокон.

На следующий день начинается подготовка заряда, которая проходит в последнем оружейном отсеке. На пути у корабля появляются гигантские алмазы. Ребекка пытается от них увернутся, но у неё не получается и алмаз повреждает последний отсек. Серж передаёт всё необходимое для активации заряда Джошу, но сам не успевает покинуть отсек. Ребекка не отменяет автоматическую систему сброса, так как повреждённый отсек может привести к гибели всего корабля и Серж погибает на глазах у своего друга.

Через несколько дней команда достигает ядра. Но там они узнают, что мощность ядерного заряда слишком мала и не сможет дать толчок ядру.

В игру снова вступают военные со своей программой под кодовым названием D.E.S.T.I.N.Y. (СУДЬБА). Выясняется, что ядро Земли было дестабилизировано именно из-за этого проекта, первоначальной задачей которого было вызывать землетрясения на территории противника. Военные собираются использовать D.E.S.T.I.N.Y для повторного «запуска» ядра, однако Джош уверен, что это только усугубит ситуацию и ядро остановится окончательно и бесповоротно. К тому же, экипаж «Вергилия» при этом неизбежно погибнет.

Тем временем прямо над Сан-Франциско появляется дыра в электромагнитном поле, через которую начинает проникать солнечная радиация. Из-за жары заживо сваривается рыба в воде, люди получают ожоги, а шины автомобилей лопаются и становятся жидкими. Смертоносные лучи мгновенно разрушают Мост Золотые ворота, а затем и весь город.

Пока Крыс взламывает код доступа, чтобы застопорить ход операции, «терранавты» находят выход из ситуации. По предложению Зимски один мощный заряд надо разделить на пять мелких, поместить в отсеки корабля, сбросить их и взорвать в разных точках ядра. Но для этого надо разблокировать клапан, удерживающий все отсеки вместе. Сделать это можно только если повернуть рычаг, находящийся в шахте, которая успела нагреться до температуры ядра в 5000 градусов. По жребию туда отправляется Эдвард. Он поворачивает рычаг, но из-за невыносимого жара не может вернуться обратно. По его просьбе Джош и Ребекка запускают двигатель и Эдвард погибает.

Джош и Зимски устанавливают заряды в отсеки, а Ребекка их сбрасывает. При установке предпоследнего заряда «Вергилий» задевает энергетический выброс ядра, и заряд опрокидывается на Джоша. В последний момент заряд падает на Зимски и ему приходится остаться в отсеке. Ребекка не зная, что произошло, сбрасывает отсек. Из-за перегрева реактора корабля Джош отключает его питание. Он перетаскивает топливную сборку для усиления последней бомбы, как ему велел Зимски и вручную сбрасывает отсек. При этом он сильно обжигает руки.

Заряды начинают взрываться один за другим. Ядро вновь начинает вращаться, а по поверхности проходит одна большая сейсмическая волна. Во время одного из взрывов погибает Зимски.

Джош и Ребекка находят способ вновь запустить корабль. Ударной волной их выбрасывает в мантию. Во время прохождения через кору центр управления теряет с ними связь. Спустя некоторое время единственный уцелевший отсек «Вергилия» оказывается на океанском дне. Без тепла корабль не может подняться из воды. Его находят благодаря пению китов и сообразительности Крыса, и вскоре Джоша и Ребекку поднимают на поверхность.

Неделю спустя Крыс запускает в Интернет имеющуюся у него информацию о миссии «Вергилия» и мир узнаёт о происшествии и имена своих спасителей.

Интересные факты

• В прокате фильм собрал всего 74 млн долларов, не окупив тем самым затраты на производство (60 млн долларов) и рекламу (25 млн долларов).
• В заключительных титрах фильма звучит песня Echelon группы 30 Seconds to Mars.

В ролях