При проникновении происходит схватка с начальником охраны — Фредериком Рыжим, в ходе которой тот погибает. После этого Альтаир возвращается на конспиративную квартиру сопротивления, но её посетили тамплиеры, и похитили Марию. Убийце удается отследить её до Соборной площади, где магистр Бушар под охраной обвиняет народ острова в убийстве Фредерика. Мария сообщает Бушару о прибытии Альтаира, но тот приказал арестовать её, считая участницей заговора ассасинов.

Альтаир освобождает её, но Мария всё равно считает его своим врагом. После этого они встречаются с Александром, и тот говорит об отъезде Армана в Кирению, куда по слухам были отправлены и артефакты. Из-за этого Альтаир и Мария отправляются в этот город.

Третий блок памяти

Во время прибытия в порт, на корабль нападают пираты. Марию спасает бунтовщик Маркос. В их отделении Альтаир встречается с представителем местного отделения восставших в Кирении — Варнавой, который сообщает ему о замке Буффавенто. Там Арманд держит пленников, а также хранит важное имущество ордена.

По просьбе Варнавы, Альтаир убивает местного купца Иону. На Марию и Маркоса нападают тамплиеры, под командованием религиозного фанатика Молоха (имевшего прозвище «Бык»), но ассасин спасает их. Смерть купца вызывает серьёзные беспорядки, однако глава отделения говорит о благе этого преступления для восстания. Альтаир отправляется в местный замок, и после долгой схватки убивает Молоха.

Четвёртый блок памяти

Возвратившись назад, Альтаир обнаруживает, что тамплиеры пленили всех восставших, а Варнава оказался их агентом. Ассасин не даёт храмовникам казнить бунтовщиков, и освобождает пленных. Но Марию забрал сын Молоха — Шалим, и после беседы с Маркосом Альтаир решает отправиться к Тёмному Оракулу, с помощью которой Арман Бушар знает о всех действиях и планах сопротивления.

Проникнув в замок Буффавенто, убийца узнаёт о побеге Марии, а также о том, что Александр работает на тамплиеров. Оракул, встретив Альтаира, нападает на него, и ему приходится убить её.

Пятый блок памяти

Возвратившись назад, ассасин решает найти Шалима, и от него узнать об его ордене и архиве. Для этого Альтаир сначала убивает его спутников, а потом начинает искать монаха, которому исповедуется его цель. Но священника убивает таинственный убийца, так что остаётся только найти Шалима в гавани.

Там герой встречает Марию, направляющуюся в замок Святого Иллариона. Проникнув в крепость, Альтаир находит Большой зал, и позже сражается с Шалимом и его братом Шахаром. В ходе боя ассасин убивает их обоих. Вернувшись в Кирению, Альтаир узнаёт о том, что корабли тамплиеров покидают городские гавани Кирении, и возвращаются в Лимасол.

Шестой блок памяти

Прибыв туда, герой встречается с Александром, и обвиняет того в измене восстанию, но, тем не менее, он оказывается ни при чём, а информация о предательстве Александра — ложью. Оказывается, Александр думал, что предатель — Альтаир. Однако убийство Ионы сплачивает остальных вокруг своего лидера, который к тому же говорит о недавних грабежах и убийствах, совершённых храмовниками в Лимасоле.

Из-за этого Альтаир решает отомстить тамплиерам и нападает на их пиратский корабль. Кроме того, он убивает других городских представителей ордена. Допросив одного из них, герой выходит на городского портного Деметриса, но того убивают метательным ножом. Возвратившись в штаб повстанцев, Альтаир находит письмо от Александра, просящего о встрече во внутреннем дворике замка. Но там ассасин находит лишь его бездыханное тело. Его убийцей оказывается человек, выдававший себя за Варнаву.

В это время городская толпа находит Альтаира, и он использует Яблоко Эдема. Рассказав им о тамплиерском обмане, ему удаётся успокоить людей. Наёмный убийца пытается отнять артефакт, но его убивает Мария. После этого на них нападают храмовники, и они находят потайной ход внутри замка.

Седьмой блок памяти

Альтаир обнаруживает себя в архиве, находящемся внутри замка Лимасола. Прорываясь с боями через стражу, он обнаруживает Бушара, сражающегося с Марией. Альтаир нападает на него, и в ходе боя магистр рассказывает о причинах прибытия тамплиеров.

Долгие десятилетия остров принадлежал им, так как византийские императоры из династии Комнинов признавали их авторитет и власть. Только Исаак Комнин, провозгласивший себя правителем Кипра, из-за своей глупости потерял свою корону. Опасаясь того, что архивы достанутся Ричарду I, храмовники выкупили остров у него. Но теперь пришло время покинуть Кипр, а артефакты уже доставлены в другое место.

Арманд говорит Альтаиру, что тот должен оставить орден в покое. На что убийца говорит о том, что Яблоко Эдема останется у него самого, так как тамплиеры потеряли смысл своей веры. Альтаир убивает своего противника, и спасает Марию из разрушающегося здания архива.

Бонусы

В 2009 году на выставке E3 было объявлено о том, что при подключении системы PlayStation Portable к PlayStation 3 (с игрой Assassin’s Creed II) и синхронизации данных в обеих играх даются бонусы. Например, в AС2 станет доступно оружие всех 6 боссов игры Bloodlines и увеличится количество денег. В игре для PSP при этом увеличивается уровень здоровья, меняются контратаки, и появляется возможность блокировать удары скрытым клинком. Также игрок получает возможность пользоваться клинком в качестве арбалета. Все эти возможности станут доступны только при полном прохождении обеих игр.

Рецензии зарубежной прессы

Assassin’s Creed: Bloodlines получила сдержанные отзывы от критиков.

Обозреватель GameSpot поставил игре оценку 5.5. баллов из 10, отметив недочёты в механизме поединков и поведении простых жителей. Кроме этого был отмечен слабый AI противников, «не способных обнаружить рядом с собой убийства». В то же время похвалы удостоилась звуковое оформление.

В свою очередь, рецензент IGN оценил проект на 6.9 баллов из 10. Он отметил игровую графику, а недостатком посчитал однообразность звуковых эффектов и слишком большое акцентирование на схватках.

GameSpy поставил игре 2.5 балла из 5. Обозреватель отметил хорошо продуманное управление, но разругал однообразный игровой процесс и плохое озвучание персонажей.

Локализация

Игра была локализирована компанией «Акелла».

Роли озвучивали:
Всеволод Кузнецов — Альтаир;
Татьяна Шитова — Мария;
Александр Груздев — Арман Бушар, Маркос, «Бык»;
Денис Некрасов — Александр;
Елизавета Шевчук — голос «Анимус»;
Дмитрий Филимонов — Иона, Шалим, эпизодические персонажи;
Вячеслав Баранов — Шахар;
Влад Копп — тамплиеры;