На вокзал Кингс-Кросс семья Уизли и Гарри едут на Форде Англия. Гарри и Рон должны попасть на тайную платформу волшебников последними, но у них это не получается: барьер, через который они должны пройти, их не пускает. В отчаянии от того, что они могут опоздать, они берут машину отца Рона и летят в Хогвартс на ней. Прилетев туда, машина случайно врезается в Гремучую Иву. Гарри и Рон, опаздывая, бегут к замку.

Начинаются учебные дни. Гарри ходит на лекции и отрабатывает наказание за свое опоздание, отвечая на почту поклонников Златопуста Локонса. После очередного вечера, проведенного за «наказанием», Гарри слышит странный шепот, который издается из стен. Позже, уже идя с Роном по коридору, Гарри слышит этот же шепот и даже различает некоторые слова, но Рон отвечает, что услышал лишь какое-то шипение.

Происходит торжественное открытие Клуба Дуэлей. Первым участником волшебного поединка оказывается Гарри, а его соперником — Драко Малфой. В схватке, Драко использует недопустимое заклинание и вызывает живую змею. Однако, вопреки задумке Малфоя, змея набрасывается на одного из зрителей. Тогда Гарри открывает в себе способность повелевать змеями и приказывает змее оставить в покое ученика. Публика странно реагирует на его действия и смотрит на него с подозрением. После поединка, Рон рассказывает Гарри, что тот, по видимому, змееуст. Так называется редкое умение разговаривать со змеями, которым обладали преимущественно темные волшебники, в числе которых — Волан-де-Морт, убийца родителей Гарри.

Позднее Гарри Поттер сталкивается с таинственными событиями: кто-то превращает обитателей Хогвартса в окоченевшие статуи, а на стене в коридоре третьего этажа появляется кровавая надпись «Тайная комната открыта, враги наследника — трепещите». Из-за способности с Гарри говорить со змеями, все подозрения падают на него. В то же время, учителя отрицают возможность существования Тайной комнаты, в которую, согласно легенде, один из основателей школы — Салазар Слизерин, заточил древнейшее зло.

Персонажи

• Гарри Поттер — главный герой, двенадцатилетний волшебник, ученик второго курса школы Хогвартс.
• Рон Уизли и Гермиона Грейнджер — друзья Гарри, сопровождающие его в некоторых игровых эпизодах. Кроме того, они показывают игроку дорогу к различным аудиториям и окрестностям Хогвартса.
• Фред и Джордж Уизли — братья Рона, продавцы снаряжения для игры в квиддич.
• Альбус Дамблдор — директор Хогвартса.
• Профессор Минерва Макгонагалл — декан факультета Гриффиндор, преподаватель урока Трансфигурации.
• Профессор Златопуст Локонс — преподаватель Защиты от Тёмных Искусств.
• Профессор Северус Снегг — преподаватель Зельеварения.
• Профессор Помона Стебль — преподаватель Травологии.
• Профессор Филиус Флитвик — преподаватель Заклинаний.
• Мадам Поппи Помфри - школьная медсестра.
• Драко Малфой — ловец команды Слизерина, соперник Гарри по квиддичу и в Дуэльном Клубе.
• Рубеус Хагрид — лесничий и хранитель ключей Хогвартса.
• Том Марволо Реддл, он же Лорд Волан-де-Морт — бывший ученик Хогвартса, чей дневник однажды найдет Гарри.

Игровой процесс

Игровой процесс игры представлен в виде аркады с обзором от третьего лица, сочетая в себе простые элементы квеста. Между обязательными сюжетными заданиями, игрок может изучать секреты замка, участвовать в турнирах по квиддичу, а также посещать Клуб Дуэлей. За участие в мини-играх, исследование территорий Хогвартса и поиски скрытых мест, игрок получает бонусы — волшебные конфетки (Бобы) Берти Боттс, которые служат своеобразной валютой в Хогвартсе — на них можно покупать у других учеников коллекционные волшебные карточки, зелье и «исцеляющих» здоровье шоколадных лягушек, а также спортивное снаряжение у Фреда и Джорджа.