После этого агент снова отправляется в штаб АДБ. В заставке Сэм говорит Уильямсу, что троица заложила 5 бомб в трёх городах (Лос-Анджелес, Нэшвиль и Нью-Йорк). Задача Сэма — взять образец красной ртути и обезвредить бомбы, находящиеся в штабе АДБ. В отличие от первой миссии в штабе, игрок идёт на другую часть запретной территории. Но по её ходу выясняется, что Эмиль раскрыл Ламберта. Появляется выбор — убить Ламберта или отправить письмо, где говорится, что тот не агент.

Последняя миссия проходит в Нью-Йорке. Задача игрока — обезвредить другие установленные бомбы. Фишер и другие наёмники АДБ прыгают с самолёта на парашюте, но, когда Фишер уже спрыгнул, Сайкс сообщает Эмилю, что Фишер — шпион Эшелона, и Эмиль прыгает из почти что закрывшегося отсека самолёта. В начале миссии Фишер сообщает Уильмсу, что его раскрыли и тот говорит Сэму, чтобы он убил всех, включая Энрику. Фишер недоволен этим, но он соглашается, чтобы позже её спасти. Фишер убивает всех «рядовых», потом ловит Джейми и убивает его. Поймав Сайкса и не узнав ничего полезного, он поступает с ним аналогично.

После того, как Сэм проходит на другой небоскрёб по верёвке, он встречает Энрику, которой обещает, что после всего этого они уедут вместе. Она ему сообщает местоположение Мосса и Эмиля.

Сэм находит Мосса и убивает его. И, наконец, он находит Эмиля с последней бомбой, но тот застаёт Сэма врасплох, отстрелив у него из рук автомат и заставив выкинуть пистолет. Эмиль разочаровывается в Фишере и стреляет, но Сэм отпрыгивает от пулемётной очереди в сторону и пробирается через лазеры до Эмиля, которого он убивает.

Затем демонстрируется ролик, где Энрика, вышедшая на заснеженную крышу, видит человека вдалеке и кричит: «Сэм! Это ты?» Происходит несколько выстрелов, и выбегающий Сэм обнимает Энрику,

которая умирает у него на руках. Её убийца, агент Эшелона, подходит к трупу, но не находит Сэма. Через несколько секунд Сэм выпрыгивает из снега и перерезает горло агенту. В последнем ролике Сэм обвиняет Уильмса в убийстве Энрики, но тот утверждает, что та была террористкой и получила по заслугам.

Миссии

PC, PlayStation 3, Xbox 360

PlayStation 2, Xbox, Wii, GameCube