Франц Алоис Теодор Коммер (Franz Aloys Theodor Commer; 1813, Кёльн — 1887, Берлин) — немецкий композитор и историк музыки.

Ученик А. Б. Маркса. Работал как органист и дирижёр в Берлине и Мюнхене, затем в большей степени посвятил себя музыковедению. В 1868 г. вместе с Робертом Айтнером был в числе соучредителей берлинского Общества изучения музыки (Gesellschaft für Musikforschung) и до конца жизни исполнял обязанности его президента.

Наиболее известен как редактор и составитель многотомных изданий музыки XVI и XVII веков, в том числе серии «Musica sacra. Sammlung der Meisterwerke des XVI, XVII und XVIII Jahrhunderts» (38 выпусков начиная с 1839 года), фундаментального собрания нидерландской музыки XVI века (Collectio operum musicorum Batavorum saeculi XVI; 1844—1858) и т. д. Один из соредакторов собрания сочинений Палестрины.

Среди собственных музыкальных сочинений Коммера, относящихся преимущественно к раннему периоду его карьеры, — музыка к «Лягушкам» Аристофана и «Электре» Софокла.