1999

• 10 февраля 1999 — 4-й официальный сингл «Memory Seishun no Hikari».
• 18 апреля 1999 — Асука Фукуда покидает группу, чтобы продолжить обучение.
• 12 мая 1999 — 5-й официальный сингл «Manatsu no Kōsen».
• 14 июля 1999 — 6-й официальный сингл «Furusato».
• 28 июля 1999 — второй альбом «Second Morning».
• август 1999 — по результатам «Morning Musume 2nd Tsuika Audition» (Прослушивание 3-го поколения) Маки Гото становится новой участницей группы.
• 9 сентября 1999 — 7-й официальный сингл «Love Machine».
• ноябрь 1999 — создание второй официальной подгруппы Petitmoni, также известной, как Pucchi Moni.В первый состав вошли: Кэй Ясуда, Саяка Итии, Маки Гото.

2000

• январь 2000 — Ая Исигуро покидает группу.
• 26 января 2000 — 8-й официальный сингл «Koi no Dance Site».
• 23 марта 2000 — третий альбом «3rd-Love Paradise».
• 9 апреля 2000 — у Момусу появилось собственное ТВ-шоу под названием Hello! Morning, которое сильно увеличило их популярность. Было выпущено огромное количество сопутствующих товаров — различные календари, фотокниги, постеры и другие. Была даже выпущена игра для видеоприставки Playstation 2 под названием Space Venus.
• апрель 2000 — по результатам «Morning Musume 3rd Tsuika Audition» (Прослушивание 4-го поколения) Рика Исикава, Хитоми Ёсидзава, Нодзоми Цудзи и Аи Каго вошли в состав группы.
• 17 мая 2000 — 9-й официальный сингл «Happy Summer Wedding».
• май 2000 — выпуск Саяка Итии.
• 14 июня 2000 — 1-й официальный сборник клипов «VIDEO THE MORNING MUSUME BEST10».
• 6 сентября 2000 — 10-й официальный сингл «I Wish».
• 13 декабря 2000 — 11-й официальный сингл «Renai Revolution 21».

2001

• 31 января 2001 — первый сборник лучших хитов «Best! Morning Musume 1».
• 15 апреля 2001 — лидер группы Юко Накадзава покидает группу, чтобы начать сольную карьеру.
• 25 июля 2001 — 12-й официальный сингл «The Peace!».
• 26 августа 2001 — по результатам «Morning Musume Love Audition 21» (Прослушивание 5-го поколения) Такахаси, Асами Конно, Макото Огава и Ниигаки вошли в состав группы.
• 31 октября 2001 — 13-й официальный сингл «Mr. Moonlight: Ai no Big Band».

2002

• 21 февраля 2002 — 14-й официальный сингл «Souda! We’re Alive».
• 24 июля 2002 — 15-й официальный сингл «Do It! Now».
• 27 марта 2002 — четвёртый альбом «4th Ikimasshoi!».
• сентябрь 2002 — выпуск Маки Гото.
• 30 октября 2002 — 16-й официальный сингл «Koko ni Iruzee!».
• 4 декабря 2002 — 2-й официальный сборник клипов «PICTURE OF THE MORNING MUSUME.2 -SINGLE M CLIPS-».

2003

• 19 февраля 2003 — 17-й официальный сингл «Morning Musume no Hyokkori Hyōtanjima» .
• 23 апреля 2003 — 18-й официальный сингл «As for One Day».
• 26 марта 2003 — пятый альбом «No. 5».
• 19 января 2003 — 6-е поколение: Фудзимото, Камэи, Митисигэ и Танака.
• июль 2003 — выпуск Кэй Ясуды. Во время прощального концерта Цунку заявил что в группе никогда не будет более 16 участниц.
• 30 июля 2003 — 19-й официальный сингл «Shabondama».
• 6 ноября 2003 — 20-й официальный сингл «Go Girl: Koi no Victory».

2004

• 9 января 2004 — Цунку удивил всех, объявив, что никто не прошёл Morning Musume Lucky 7 Audition (Прослушивание 7-го поколения) по причине высоких запросов к конкурсанткам.
• январь 2004 — Нацуми Абэ (которую также называли «лицом Morning Musume») покидает группу, чтобы начать сольную карьеру.
• 21 января 2004 — 21-й официальный сингл «Ai Araba It’s All Right».
• 31 марта 2004 — второй сборник лучших песен «Best! Morning Musume 2».
• 12 мая 2004 — 22-й официальный сингл «Roman: My Dear Boy».
• 22 июля 2004 — 23-й официальный сингл «Joshi Kashimashi Monogatari».
• 3 ноября 2004 — 24-й официальный сингл «Namida ga Tomaranai Hōkago».
• 8 декабря 2004 — 6 альбом «Ai no Dai 6 Kan».
• 15 декабря 2004 — сборник песен «Early Single Box».