Свой следующий, третий по счету альбом, под названием Pierced from Within группа выпустила 23 мая 1995 года на лейбле Roadrunner Records. Продюсером альбома Pierced from Within стал Скот Барнс, также он стал инженером звукозаписи и произвел микширование, ассистентом Скота Барнса стал Стив Харитейдж и Дэйв Уэлнер, запись и сведение альбома было произведено на студии Morrisound Recording, Флорида США, мастеринг произвёл Майк Фулнер на студии Fullersound, Флорида США. Оформлением альбома занимался Хиро Такахаси.

Распад группы — Воссоединение (1998—2002)

В 1998 году Suffocation воспользовались услугами продюсера Скотта Бернса и вместе с ним подготовили мини-альбом Despise the Sun. EP содержал пять песен: «Funeral Inception», «Devoid of Truth», «Despise the Sun», «Bloodchurn», «Catatonia»; вышел EP Despise the Sun лейбле Vulture Records очень малым тиражом. В 2000 году лейбл Relapse Records, переиздал Despise the Sun, но раздоры в группе не позволили «Suffocation» двигаться дальше. Легендарный Дуг тем временем участвовал в записи первого альбома Hate Eternal 1999 года, для которого он написал 3 композиции. Он не принял участие в туре в поддержку альбома, якобы предполагая, что Death Metal утратил свою актуальность, и стал работать инженером. Таким образом, группа прекратила существование.

Первые слухи о возрождении группы начали ходить в 2002 году и, в конце концов, подтвердились. Новый состав группы выглядел следующим образом: Фрэнк Муллен, Майк Смит, Терренс Хоббс, Гай Марчейз и Дерек Бойер. Летом 2003 года Suffocation выпустили клип «Deceit», а затем отправились в студию, где начали работу над новым альбомом.

Майк Смит в одном из своих интервью прокомментировал дальнейшую деятельность группы, после воссоединения:

Souls to Deny — Suffocation (2002—2006)

Через год после после своего воссоединения группа выпускает свой четвёртый альбом Souls to Deny, который был выпущен 27 апреля 2004 года на лейбле Relapse Records. Продюсером альбома Souls to Deny стала сама группа, инженером звукозаписи и микшированием занимался Джо Синкотта, запись альбома проходила с января-февраль 2004 года на студии Full Force Studio, Нью-Йорк США, мастеринг альбома произвёл Скот Хулл на студии Visceral Sound. Оформлением альбома занимался Дэн СиаГрайве. На песню «Surgery of Impalement» было снято видео шедшее как бонус к альбому.

Майк Смит в одном из своих интервью прокомментировал выбор лейбла Relapse Records после воссоединения:

В 2005 году группа подготавливает материал для DVD под названием The Close of a Chapter, но есть две версии этого концерта Suffocation. Оригинал имеет точно такой же треклист, но заключительное вариан отличается от оригинала, согласно Майку Смиту там только 50%

от оригинального концерта. Relapse Records выпустили этот концерт в новой версии как «The Close of a Chapter: Live in Quebec City», 27 октября 2009 года в Северной Америке и 2 ноября 2009 по всему миру.

Следующим альбомом группы, пятым по счету, стал альбом с одноименным названием Suffocation, который был выпущен 19 сентября 2006 года на лейбле Relapse Records. Инженером звукозаписи и микшированием занимался Джо Синкотта, запись альбома проходила с мая-июнь 2006 года на студии FullForce Studios, Нью-Йорк США, мастерингом занимался Алан Доучес, оформление альбома сделал Джон Зиг, фото группы сделал Скотт Кинкайде, дизайн альбома сделал Орион Ландау.

Blood Oath — настоящее время (2009-)

Suffocation заключают контракт с лейблом Nuclear Blast Records, на котором группа выпускает свой шестой альбом под названием Blood Oath, который был вупущен 3 июля 2009 года. Инженером звукозаписи стал Джо Синкотта, а микшированием занимался Зак Охрен. Оформлением альбома занимался Джон Зиг.