Автор ряда монографий и самостоятельных глав в книгах.

Публиковался в «Вестнике Ленинградского государственного университета имени А. С. Пушкина, серия Филология», Тульского государственного университета, Тульского государственного педагогического университета имени Л. Н. Толстого; в журналах — «Organizmica», «Вестник новых медицинских технологий» (издаются самим Тюняевым), «Естественные и технические науки» (нерецензируемый), «Обозрение прикладной и промышленной математики», «Научная жизнь» (нерецензируемый), «Вестник развития науки и образования» (нерецензируемый), «Научное обозрение» (нерецензируемый), «Наука и религия», «Объединённый научный журнал», «Рукопашный бой» и других. В 2008 г. был аспирантом Московского государственного горного университета (научный руководитель — С. А. Редкозубов), однако диссертацию не защитил.

Участвовал в конференциях Института всеобщей истории РАН, Государственного института русского языка имени А. С. Пушкина.

Андрей Тюняев является главным редактором сайта www.dazzle.ru, который представляет собой расширенную версию газеты «Пенсионер и общество» и регулярно публикует материалы антисемитской направленности. Фамилии евреев в таких публикациях выделяются синим цветом. В разделе «Чужие» поддерживается «Реестр фашистско-сионистских организаций».

Критика

• Ученый-атомщик и публицист Юлий Андреев считает, что «на унавоженной бедностью почве пышно расцвела лженаука, все эти „торсионные поля“ Акимова, „азиопы“ Фоменко, „организмики“ Тюняева». «Тюняев в своих многотомных „трудах“ несет околесицу, лишь бы заработать деньги и известность, паразитируя на дураках».
• Историк Артур Чубур писал: «следует отметить, что в последнее десятилетие в России наблюдается опасная тенденция массовых лженаучных фальсификаций псевдопатриотической и националистической направленности в области древнейшей истории населения Восточной Европы. Яркие примеры — публикуемые в журнале самодеятельной Академии фундаментальных наук „Organizmica“ работы А. А. Тюняева, не менее одиозны псевдоисторические публикации П. М. Золина, В. А. Чудинова, Ю. Д. Петухова». Он также отметил, что кандидат технических наук и детский писатель А. А. Тюняев избрал себя президентом созданной им самим «Академии фундаментальных наук» и прославился созданием системной лженауки «Организмики» и одноименного журнала.
• Историк Е. В. Пчелов в своём отзыве на фильм М. Н. Задорнова «Рюрик. Потерянная быль» пишет, что «Приписав генетике этническое значение, Задорнов вслед за А. А. Клёсовым (который, к слову сказать, вместе с псевдоучёным А. А. Тюняевым, основоположником «науки» организмики, издал большую книгу о происхождении человека) уверился в величии славян, откуда только и могли прийти на будущую Русь варяги-русы, т. е. русые солевары.»

Книги

1. Клёсов А. А. и Тюняев А. А., Происхождение человека (по данным археологии, антропологии и ДНК-генеалогии). — М.: Белые Альвы. 2010.

# Праязык: Опыт реконструкции. (Колл. авт.). — М.: Белые Альвы. Т. 1. 2009.

1. Тюняев А. А. Периодическая система элементарных частиц // Организмика — фундаментальная основа всех наук. Том III, Физика // Под ред. д. ф.-м. н., профессора О. А. Хачатуряна. — М.: Спутник+, 2009.

# Тюняев А. А. Синдром гомеологическо-хромосомного иммунодефицита // Организмика — фундаментальная основа всех наук. Том III, Медицина // Под ред. д. б. н., профессора О. Д. Дорониной. — М.: Спутник+, 2009.

1. Тюняев А. А. История возникновения мировой цивилизации (системный анализ). — М.: 2006—2009.

# Эволюционная экономика: инновации, инвестиции, институты, интеллектуальный капитал: Коллективная монография". Под научной редакцией Н. А. Шайденко и М. П. Переверзева. — Тула: Изд-во Тульского государственного педагогического университета им. Л. Н. Толстого, 2008. — 460 С, раздел 1, п. 1.5., с. 104—113.

1. Тюняев А. А. Языки мира (учебное пособие). — М.: Ин, 2007—2008.

# Тюняев А. А. Организмика — фундаментальная основа всех наук. Том I. — М.: Ин, 2004, 368 с.

1. Тюняев А. А. Организмика — новая фундаментальная наука. Начала. — М.: Ин, 2003, 80 с.