Понимание опасности, которую представляет связь между двумя мирами, заставляет Эдварда вернуться, чтобы уничтожить Врата на Земле, при этом Ал по его плану должен запечатать Врата в Аместрисе, хотя после этого Элрик-старший останется на Земле навсегда. Тем временем нацистский мятеж в Мюнхене провалился. Когда Эккарт возвращается на Землю, то оказывается покрыта тенью существ из Врат, и её убивают собственные соратники, приняв за чудовище. Эд не знает, что за ним на Землю последовал младший брат, к которому стала возвращаться память. После похорон Хайдерих братья Элрики вместе с Ноа уезжают, намереваясь найти и уничтожить ядерную бомбу, привезённую на Землю из Аместриса. Эдвард говорит брату, что перестал считать этот мир чужим.

Новые персонажи

См. также: Список персонажей аниме и манги «Стальной алхимик».

• Арифонсу Хайдерихи — молодый немецкий изобретатель, занимающийся ракетной техникой. Подружился с Эдвардом Элриком после того как тот оказался на Земле, предоставил ему комнату в своём доме в Мюнхене. Внешне очень похож на младшего брата Эдварда, Альфонса Элрика. Обладает спокойным характером и охотно слушать истории Эда о его родном мире родной, хотя и сомневается, действительно ли они подлинные. Поддерживает намерения Эдварда вернуться домой. Страдает от смертельной болезни лёгких и надеется прославиться прежде чем умрёт. Далёк от политики, в то же время считает, что Германия прекратила войну когда могла ещё сражаться, хочет усиления страны, поэтому явные цели Обшества Туле не вызывают у него протеста. Не разделяет расистские взгляды нацистов, хорошо относясь к цыганке Ноа. Ценой своей жизни помогает Эдварду вернуться в Аместрис.

Сэйю: Сюн Огури.

• Деторинде Эккаруто — глава Общества Туле и главный антагонист фильма. Её прототипом является реальный политик и член Общества Туле Дитрих Эккарт. Амбициозная молодая женщина, которая хочет открыть ворота в мир Эдварда, полагая, что это мифическая страна «Шамбала», захватив которую можно будет править всем миром. Эккарт полагает, что сможет использовать знания и оружие Аместриса, чтобы завладеть миром. В отличие от остальных членов Общества Туле лишь на словах поддерживает Гитлера, намереваясь в дальнейшем его свергнуть. Пройдя через Врата она получает способность использовать алхимию. Однако, оказавшись в другом мире, она решает, что алхимия Аместриса сильнее науки Земли и опасаясь, что местные алхимики захватят её родной мир, решает уничтожить мир «чудовищ». Когда Эккарт возвращется в свой ​​мир, она оказывается покрыт тенью существ из Врат, и её, приняв за чудовище, застрелил полицейский-нацист, внешне похожий на Маэса Хьюз, персонажа из манги.

Сэйю: Казуко Като.

• Ноа — молодая цыганка, способная видеть судьбу и читать мысли людей. Внешне очень похожа на Розу Томас, персонажа из манги. Соплеменники продали её людям из Общество Туле, но девушка, испуганная мыслями купившего её человека, сбегает. Бежать ей помогает Эдвард Элрик, затем привёдший её в дом Хайдериха. Ноа трудно жить в Германии, где она то и дело подвергается дискриминации и нападкам со стороны многих немцев, считающих всех цыган ворами. В то же время она прочла воспоминания Эдварда о его родном мире и буквально очарована ими, вопринимая Аместрис как идеальный мир, где можно жить не опасаясь расистов. Поэтому когда к ней обращаются люди из Обществу Туле, она соглашается помочь им открыть портал в другой мир, надеясь, что сможет туда уйти. Для этого она, пока Эдвард спит, читает его воспоминания, в том числе о том как он открывал Врата. В конце фильма отправляется в странстиве вместе с братьями Элриками.

Сэйю: Мию Савай.

В фильме, помимо братьев Элриков, фигурируют и другие персонажи из оригинальной манги и аниме. Среди них отец братьев Хоэнхайм, их подруга Уинри Рокбелл, её бабушка Пинако Рокбелл, бывший начальник Элриков Рой Мустанг, его подчинённые Алекс Луис Армстронг, Риза Хоукай, Жан Хавок и Каин Фьюри, гомункулы Обжорство, Зависть и Гнев, библиотекарь Ческа. Некоторые персонажи имеют прототипов из истории Германии XX века. Помимо Дитлинде Эккарт (прототип Дитрих Эккарт) это также один из руководителей Общества Туле Карл Хаусхофер, командир боевиков общества Рудольф Гесс, кинорежиссёр Фриц Ланг, лидер нацистов Адольф Гитлер.