«Чистильщики» (ZOCOM)

Командование зональных операций — элитное подразделение созданное во время Третьей тибериевой войны, состоящее, в основном, из ветеранов, высокотехнологичных солдат GDI, оборудованных для борьбы с планетарным тибериевым заражением и очищением Красных зон Земли. Войска «Чистильщиков» обращаются с технологиями связанными с последними достижениями в области звукового оружия, особой телесной брони способной противостоять разрушительному эффекту тиберия, а также тактиками подавления. Эта под-фракция заменяет стандартных штурмовиков на так называемых «рейдеров внешней зоны» (Zone Raider, далее - штурмовесс, в русской локализации - элитных штурмовиков) — специально обученных девушек-пехотинцев в новой противотибериевой броне, вооружённой зенитными ракетами (правда, малоэффективными) и вакуумными гранатомётами, ведущими огонь особыми ультразвуковыми гранатами. Кроме того, их «Касатки» вооружены аналогичными имеющимся у штурмовесс ультразвуковыми гранатами вместо стандартных ракет «воздух-земля». Также, «Чистильщики» получают модифицированную версию бронетехники класса «Громовержец», отличающиеся от стандартной удлинённым стволом орудия и возможностью перенаправить энергию на орудие для сверхмощного выстрела за счёт, однако, временного отключения систем управления. Стандартная композитная броня пехоты ГСБ у Чистильщиков заменена на более эффективные полевые тибериевые скафандры.

Кстати, надо заметить что штурмовессы способны неплохо сражаться с пехотой, в отличие от стандартных штурмовиков. Но вертолеты при этом, даже учитывая что у штурмовесс есть зенитки, все равно могут уничтожать их отряды.

Братство Нод

Новые войска

• «Харон» (Reckoner APC) — тяжёлый бронетранспортёр с бойницами; при получении критических повреждений или по приказу превращается в постоянный бункер. В состоянии бронетранспортёра может содержать 2 отряда пехоты, в состоянии бункера - 3; огонь ведётся только из развёрнутого транспортника. Высокая защищённость от всех видов оружия, солдаты не могут быть уничтожены ни гранатами, ни огнемётами, ни «Осами».
• «Фантом» — САУ со встроенным стелс-генератором. Представляет собой грозную силу, особенно при поддержке стелс-танков и отрядом «Теней».

«Чёрная рука» (Black Hand)((Черные братья)в русской локализации)

Ужасающий орден жрецов-воинов Братства, специализирующийся на мощных и тренированных штурмовых войсках. Стандартной пехотой «Черной руки» является отряд наставников, вооружённых галлюциногенными гранатами и противопехотными пулемётами Гатлинга, которые можно улучшить тибериевыми снарядами, наносящими сильный урон вражеской пехоте и лёгкой технике. Дружественная пехота вблизи наставников увеличивает свою скорострельность, выносливость и приобретает сопротивление к подавлению. Вся пехота «Чёрной руки» тренируется на уровне ветеранов, а их коммандо сразу получают максимальный уровень опыта. Командирам Чёрной руки позволяется иметь одновременно два коммандо на поле боя. Войска Чёрной руки также включают в себя предшественников механизированных шагоходов класса «Мародер», «Очистителей», которые, кроме мощного лазерного орудия, также вооружены короткодистанционным огнемётом и устройством подавления пехоты. Взамен, «Очистители» не могут улучшать себя дополнительными устройствами, как это может «Мародер». Все огнемёты этой под-фракции могут быть улучшены для большего урона врагу. Взамен на все эти способности, Чёрная рука не имеет никаких стелс-технологий или ВВС. Взамен на стелс-танк, Чёрная рука ввела на вооружение роботизированную ЗСУ «Богомол» (локализаторы ошибочно назвали её «Призрак», хотя это как раз тот самый стелс-танк).