В 1996 году Джон Сайкс решил возобновить деятельность Thin Lizzy, представив новую старую группу как дань уважения к жизни и трудам Фила Лайнотта. Он взял на себя роль лид-вокалиста и убедил участников последнего состава Thin Lizzy: Скотта Горэма, Брайана Дауни и Даррена Вартона — примкнуть к нему. Чтобы окончательно укомплектовать состав, был взят бас-гитарист Марко Мендоза. Данный проект подвергся критике за использование имени Thin Lizzy без Лайнотта. Данный проект только исполнял прежние хиты Thin Lizzy и не исполнял новый материал.

В 1997 году Томми Олдридж подменил Брайана Дауни, когда последний не смог участвовать в выступлении, и стал полноправным участником, когда Дауни вскоре после этого покинул группу. Этот состав оставался до 2000 года, когда группа сделала запись концертного альбома One Night Only. Группа продолжила гастролировать по американским клубам в начале 2001 года. В это время из группы уходит Вартон. Сайкс в промежутке за 2002—2003 годы выпустил два сольных альбома, в то время как Горэм работал с собственной группой 21 Guns.

Вартон позже заявил, что для Thin Lizzy будет лучше проводить меньшее количество концертов, но в более крупных местах. Он также полагал, что в этих концертах должен принять участие Брайан Робертсон. Сайкс сказал, что все бывшие участники Thin Lizzy имеют право играть в Thin Lizzy в любое время.

В 2004 году Сайкс и Горэм вновь собрали Thin Lizzy. На этот раз с привлечением бывшего басиста Angel Рэнди Грэгга и барабанщика Майкла Ли, который играл с Робертом Плантом, The Cult и другими. Данный состав гастролировал по Северной Америке зимой, а после — летом в качестве специальных гостей на концертах Deep Purple. Это состав оказался временным. В 2005 году вернулся Мендоза, а в 2007 году — Олдридж. Группа продолжала гастролировать, но выпуска нового материала в планах группы не было.

На выступлении в лондонском Hammersmith Apollo 13 декабря 2007 года у группы был новый бас-гитарист — Франческо Ди Космо.

Сайкс заявил, что нынешний Thin Lizzy — это «в большей степени трибьютная вещь,» и было бы неправильно записывать новый материал под этим названием. Он добавил, что, пока нынешние участники играют вместе, они могут делать совместные записи, но не как Thin Lizzy. В 2007 году Горэм сказал, что Линнот всё ещё получает большее одобрение на концертах, и поэтому нынешний Thin Lizzy существует не просто ради денег.

Как было объявлено, Thin Lizzy вместе с The Answer должны были стать разогревающими группами перед выступлениями AC/DC на стадионах в Англии, Ирландии и Шотландии в конце июня 2009 года, но эти выступления были отменены после того, как барабанщик Олдридж сломал в аварии ключицу. 30 июня на сайте группы было объявлено, что Сайкс покинул Thin Lizzy и все концерты до конца 2009 года были отменены или отложены.

В мае 2010 года был объявлен новый состав. К группе присоединился барабанщик Брайан Дауни, клавишник Darren Wharton, гитарист Def Leppard Вивиан Кэмпбелл, бывший басист Whitesnake Марко Мендоза (который ранее играл с Thin Lizzy в период 1996—2001 и 2005—2007 годах) и певец Рикки Уорик из The Almighty. Группа объявила тур по Великобритании на январь 2011 года.

В январе 2012 года анонимный благодетель передал компании Universal Music 150 кассет с записями неизвестных и не издававшихся ранее песен THIN LIZZY общим количеством почти 700 штук. Кассеты были переданы ему Лайноттом незадолго до смерти — и пролежали в личном архиве более 25 лет. К июню 2012 года лейбл при помощи действующих музыкантов группы пообещал отобрать, обработать и выпустить лучшие песни с этого раритетного архива.