Extra Ops — серия одиночных испытаний, которые открываются в процессе прохождения. Цели 128-ми испытаний варьируются от упражнений в стрельбе до участия в полномасштабных боях с боссами. На нескольких миссиях, действие которых разворачивается на мифическом острове, присутствуют монстры из франшизы Monster Hunter, за победу над которыми игроки награждаются уникальными предметами. Завершение миссий в режиме Extra Ops также открывает доступ к модулям Mother Base.

Versus Ops

Versus Ops — соревнования между несколькими игроками, проходящие на специальных картах. Игрок может выбрать режим индивидуального или группового «боя насмерть», захвата базы или миссии по захвату заложников. В этом режиме могут быть использованы некоторые открытые в ходе основной кампании предметы и оружие. В каждом матче может принимать участие до шести игроков, при этом на них накладываются некоторые ограничения — здоровье и психическое состояние солдат автоматически не восстанавливается, на процедуру СЛР отводится мало времени.

Сюжет

События игры разворачиваются в ноябре 1974 года в Латинской Америке, спустя 10 лет после событий Metal Gear Solid 3: Snake Eater и через 4 года после Metal Gear Solid: Portable Ops. В республике Коста-Рика в обстановке глубокой тайны создаётся целая засекреченная армия — таинственные вооруженные силы с новейшим оружием; армия носит название Peace Sentinels (Стражи мира, сокр. PS). Правительство страны, ещё в 1949 году отказавшейся от собственной армии, не в состоянии препятствовать вторжению, но и не может обратиться к более сильным соседям. Присутствие PS нарушает баланс сил между Востоком и Западом. Поэтому правительство Коста-Рики тайно нанимает Нейкед Снейка и его вооружённую группировку, чтобы те без лишнего шума разобрались с вторжением.

Персонажи

Главный герой игры — Нейкед Снейк (озвучен: Оцука/Дэвид Хейтер), возглавляющий отряд наёмников Militaires Sans Frontieres (MSF). На момент событий игры он покинул организацию «Патриотов», возглавляемую его бывшим командиром майором Зеро. Помощником Снейка является Кадзухира Миллер (озвучен: Сугита/Робин Аткин Даунс). Впоследствии к ним присоединяются лидер повстанцев Аманда Валенсиано Либре, Чико, Паз Ортега Андраде, Хью (будущий отец Хэла Эммериха) и Сесиль Косима Каминадес.

Главные антагонисты игры — сотрудник ЦРУ Хот Колдман и Рамон Галвез Мена. Для работы над проектом «Peace Walker» Колдманом была нанята британский учёный доктор Стрэйнджлав; с развитием сюжета Хью начинает испытывать к ней симпатию.

В игре присутствуют сцены-флешбеки к Snake Eater, в частности отсылки к последнему бою между Снейком и Боссом и к оставленной Евой аудиозаписи. Набор аудиофайлов становится доступен после завершения игры, в них Ева сообщает Снейку новую информацию о деятельности Босса в тот период времени, когда Снейк потерял с ней связь. На мифическом острове появляется персонаж Треня из Monster Hunter.

История

Пролог: Армия без границ

4 ноября 1974 года на побережье Баранкильи заместитель командира MSF Кадзухира Миллер представляет Снейку двух потенциальных клиентов — Паз Ортегу Андраде и Рамона Галвеза Мену. В связи с тем, что Коста-Рика не имеет армии, Галвез говорит Снейку, что правительство страны уполномочило его возглавить службу MSF и остановить вооружённую группировку противника. Миллер и Снейк, считающие, что захватчики связаны с ЦРУ, принимают предложение и в качестве базы получают морскую платформу. Снейк, изначально не желающий принимать предложение, соглашается после того, как слышит последнюю аудиозапись с голосом Босс.