Возвращение к корням

В 1997 году Ронни Морингс принял решение вернуться к тому музыкальному стилю, в котором группа работала прежде. Он вновь переименовал коллектив в Clan of Xymox и заключил контракт с лейблом Tess Records (вскоре сменившим название на Pandaimonium), чтобы выпустить новый альбом Hidden Faces, работа над которым велась в течение трёх лет. В качестве одного из продюсеров этого альбома выступил Дэйв Аллен, известный по работе с Sisters of Mercy. Критики встретили диск восторженными рецензиями, а сам Ронни Морингс впоследствии заявлял, что рассматривает дату выхода Hidden Faces как «второй день рождения» Clan of Xymox. В том же году группа, состав которой пополнился клавишницей Ниной Симич и гитаристом Робом Вонком, приняла участие в создании саундтрека к компьютерной игре Revenant. В это время Морингс также основал собственный лейбл Xymox Control, на котором впоследствии издавались многие начинающие исполнители, однако собственные релизы он предпочитал выпускать при помощи сторонних звукозаписывающих компаний.

Следующий лонгплей Creatures, вышедший в 1999 году, стал одной из самых пессимистических работ Clan of Xymox. На этом диске группа предложила слушателям «мрачную готическую электронику, приправленную гитарами и танцевальными битами». Альбом снискал признание музыкальных критиков по обе стороны Атлантики и стал «релизом месяца» по версии авторитетного немецкого издания Orkus. В его поддержку Clan of Xymox организовали масштабное турне, дав концерты во многих странах Европы, став хэдлайнерами фестиваля Castle Party, проведя совместный тур по США вместе с Front Line Assembly и в мае 2000 года выступив в Мехико перед тридцатью тысячами зрителей. Группа закрепила успех выступлениями на фестивалях Wave-Gotik-Treffen и Whitby Gothic Weekend. Материал, записанный во время живых выступлений в течение 1999—2000 годов, был собран воедино и осенью 2000 года издан в качестве двойного концертного альбома под незамысловатым названием Live. Помимо концертных записей, туда вошли видео на песни «Jasmine & Rose» и «Stranger».

В 2001 году Clan of Xymox продолжили активно гастролировать, выступив на фестивалях M’era Luna и GothAM, причём последний был организован самим Ронни Морингсом. На этом фестивале группа впервые появилась перед публикой в новом составе: Роба Вонка и Нину Симич заменили, соответственно, гитарист Пол Уиттлси и клавишница Дениз Дейкстра.

25 сентября 2001 года увидел свет девятый студийный альбом коллектива, получивший название Notes from the Underground. На этом диске к традиционным для Clan of Xymox готик-роковым и дарквэйв-композициям добавились элементы современной электронной музыки. Летом следующего года вышел двойной альбом Remixes from the Underground — фактически трибьют, состоящий из разножанровых ремиксов на песни с Notes from the Underground, выполненных такими исполнителями, как, например, Iris, Angels & Agony, In Strict Confidence и Front 242.

Выходу следующего студийного альбома Farewell предшествовал выпуск «чертовски удачного», по мнению критиков, сингла «There’s No Tomorrow». Сам альбом, состоящий из своеобразных «прощаний» с бывшими друзьями и возлюбленными, также получил высокие оценки от рецензентов, в том числе от известного авторитета в области готической музыки Мика Мёрсера.

Годом позже Ронни Морингс принял решение составить своего рода «энциклопедию творчества» Clan of Xymox, выбрав по две песни с каждого студийного альбома коллектива и издав их в компиляции. Сборник лучших работ группы вышел в сентябре 2004 года и получил название The Best of Clan of Xymox; в него вошли четырнадцать композиций, в том числе новые версии ранних песен с альбомов Clan of Xymox и Medusa, однако в компиляции не нашлось места для хитов, записанных группой во времена Xymox, — по словам Морингса, он не захотел включать их в трек-лист из-за того, что они создавались во время «кризиса идентичности» команды.