Освободившись от влияния Фонтейна, Джек получает возможность наконец осуществить свою месть. Чтобы добраться до Фонтейна, Тененбаум предлагает Джеку замаскироваться под Большого папочку, тогда одна из сестричек проведёт его к нему. По прибытии Джека, Фонтейн принимает огромную дозу АДАМа, становясь похожим на Атланта. В конце концов, Джеку и Сестричкам удаётся победить Фонтейна.

Персонажи

Главные

• Джек — протагонист игры. Он единственный выживший пассажир авиалайнера, который потерпел катастрофу рядом с тайным входом в Восторг. Джек был незаконнорождённым сыном главы города Эндрю Райана и его любовницы, танцовщицы Жасмин Жолен, у которой доктор Тененбаум от имени Фрэнка Фонтейна купила эмбрион Джека. Узнав об этом, Райан убил Жасмин. Затем доктор Сушонг по своей технологии с помощью АДАМа ускорил процесс роста Джека так, что тот за два года стал человеком, чьё физическое и умственное развитие соответствовало 19 годам. Сушонг внедрил ему в мозг фальшивые воспоминания о его мнимых родителях и жизни на маленькой ферме, которые постоянно преследовали Джека во время его путешествия по городу, и две фразы-команды: «будь любезен» («пожалуйста»), по которой Джек выполнял все последующие приказы от сказавшего, и «код тревоги „жёлтый“», с помощью которого Фонтейн мог на время остановить сердце Джека, что приводило к ухудшению его физического состояния. После создания Джека Фонтейн и Тененбаум вывезли его на большую землю, где через некоторое время его сознание было активировано фразой «будь любезен» из письма его мнимых родителей. Не понимая, что он делает, Джек угнал самолёт и спровоцировал его крушение около тайного входа в подводный город (во вступительном видео можно заметить, что другие пассажиры самолёта взяты в заложники — они сидят, пригнув головы к сиденьям, по приказу Джека). Джек для Фонтейна был «тузом в рукаве» против Эндрю Райана. Ему был нужен человек, который бы носил гены основателя города, поскольку охранная система, батисферы (средство передвижения между уровнями города) и вита-камеры (в которых возможно возрождаться после смерти) были настроены на генетический код Райана или его родственников. Таким образом, Джек являлся идеальным убийцей. Он мог остаться живым, пройдя сложную охранную систему, которую создал Райан и убить его. На запястьях Джека есть татуировка в виде цепи, которая означала рабское положение Джека и связь с пресловутой «Великой цепью».

• Эндрю Райан — основатель города и глава компании Райан корпорейшен (Ryan Industries). Бывший советский гражданин, в 1919 году он бежал в США из Советской России, спасаясь от ужасов большевизма. Вторая мировая война, бомбардировка Хиросимы и Нагасаки и разочарование в послевоенном переустройстве мира заставили его использовать своё состояние для постройки Восторга — рая для богатых и свободных на дне Атлантического океана. Райан населил свой город лучшими умами, запретил любые контакты с внешним миром, что привело к бурному развитию торговли контрабандными товарами, в которой преуспел главный враг Райана, Фрэнк Фонтейн. Позже Райан национализировал компании Фонтейна, начал жестокую борьбу против контрабандистов, ввёл смертную казнь, но это привело лишь к ещё более отчаянному сопротивлению со стороны враждебных элементов в городе. В итоге Райан был вынужден отказаться от всех своих идеалов и запереться в собственном офисе.