По состоянию на начало 2009 года, Chrono Cross является последней частью сериала, Square не выпускала новых игр в серии Chrono, несмотря на сделанное Хиронобу Сакагути в 2001 году замечание, что разработчики Chrono Cross хотели бы сделать новую игру в той же серии. В том же году Square зарегистрировала торговую марку Chrono Break в США и Chrono Brake в Японии, что побудило общественность посчитать, что Square Co. разрабатывает новую часть серии под таким названием. Тем не менее, в 2003 году Square Enix прекратила действие торговой марки в США. Такаси Токита, директор оригинальной игры, упомянул «Chrono Trigger 2» в своём интервью японскому игровому ресурсу gooGame. Юдзи Хории в 2005 году подчеркнул, что не имеет намерения возвращаться к серии Chrono, тогда как Хиронобу Сакагути в апреле 2007 года подчеркнул, что его игра Blue Dragon была своего рода «расширением Chrono Trigger». Во время интервью игровому сайту Cubed³, опубликованному 1 февраля 2007 года, старший вице-президент Square Enix Хиромити Танака заявил, что, хотя на тот момент никакого сиквела в планах компании не значилось, разработчики Chrono Cross все же могут быть снова объединены для его создания. Ясунори Мицуда выражал свои интерес в создании музыкального сопровождения для новой игры, но подчеркнул, что в серии замешано «много политики». Он подчеркнул, что в создании игры должен принимать участие Масато Като. Февральский выпуск 2008 года Game Informer поставил ожидаемый сиквел Chrono на восьмом месте среди «Десятки ожидаемых сиквелов», назвав игру «неизбывным наследием в каталогах Square Enix» и вопросив: «из-за чего же задержка, черт возьми?!». В июньском выпуске 2008 года журнала Electronic Gaming Monthly, посвящённом старым играм, журналист Джереми Пэриш назвал Chrono тем игровым сериалом, очередной части которого поклонники ждут больше всего.

Утилиты для редактирования игры

Square Co. официально не выпускала редакторов игры, однако поклонниками было разработано несколько программ для редактирования SNES-версии.

• Temporal Flux — инструментарий для хакинга Chrono Trigger, написанный в среде Microsoft .NET Framework программистом Geiger.
• Gears — пакет редакторов, позволяющих корректировать игру. Включает в себя редактор магазинов, редактор персонажей, редактор монстров и редактор диалогов. В 2001 году был заброшен.
• CTEP — Chrono Trigger Editor Companion был разработан как вспомогательный инструмент по отношению к Geiger’s/Evil Peer’s Editor.
• Chronotools — утилита для перевода игры. Была разработана финским программистом под ником Bisqwit и вносила в игру многие не предусмотренные разработчиками возможности, в частности, склонение произвольно введённых имён персонажей по падежам.

Неавторизованные ремейки на иных платформах

Официально Square никогда не делала попыток перенести Chrono Trigger на ПК, но две такие попытки предпринимали поклонники игры. Проект Chrono Resurrection был попыткой воссоздать ряд интерактивных сцен из Chrono Trigger в современной трёхмерной графике, Chrono Trigger Remake Project же был попыткой сделать полный ремейк игры с использованием современных графических технологий. Обе попытки были жёстко пресечены опасавшейся за свои авторские права Square Enix путём пересланных по почте требований о полном прекращении какой-либо деятельности. Тем не менее, на PC можно запустить оригинальную SNES-версию игры при помощи эмулятора.

В 2008 году китайской компанией Shenzhen Nanjing Technology был создан неавторизованный ремейк игры для восьмибитной игровой консоли Nintendo Entertainment System, по сей день популярной в Китае. Учитывая техническое несовершенство NES по сравнению со SNES и крайне ограниченный объём игрового картриджа, ремейк был существенно упрощён в плане графики, геймплея и сюжета. Лавос в игре не упоминается, главным противником героев и финальным боссом игры является Магус, после битвы в его замке игра заканчивается.